明朝永乐二年(公元1404年)，仿照宋代临安(今浙江杭州)的药王庙，以邳彤墓为中心，扩建药王庙。经明、清两代历次修葺，始成为的规模。

      药王庙建筑群占地3200多平方米，坐东向西，结构严整，有牌坊、马殿、钟鼓楼、药王墓亭、碑房、十大名医殿、药王正殿、后殿、关汉卿纪念堂、古槐广场组成。悬挂于山门之上的"药王庙"匾额，乃清乾隆时东阁大学士刘墉为之题写。山门外的牌坊，重檐庑殿式建筑，由黄色琉璃瓦覆盖三间四柱，彩饰斗拱。正中匾额书有"显灵河北"描金大字。牌坊两侧有一对石狮，石狮外矗立着两根高达24米的铁铸旗杆，每根重约3万斤。

      两根铁旗杆上铸有一幅对联:"铁树双旗光射斗;神庥普荫德参天。"铁旗杆上悬挂着风铃，迎风作响，给人一种悠远肃穆的感觉。药王墓亭在药王庙的中院。墓为亭式，木拱起脊，琉璃瓦顶，外形玲珑别致，富有民族特色。墓碑上书有"敕封明灵昭惠显王之墓"。墓碑南北两廊及西面，碑碣林立，有几十块之多，记载着药王庙和药都的发展变化。

      在药王庙亭南北两侧的配殿里，塑有我国扁鹊、华佗、张仲景、张子和、刘河间等十大名医人物像。这些塑像，据传为天津泥人张远祖之作，工整精细，形神兼备。

      药王正殿是药王庙的主殿，殿中正位为药王身着龙袍的全身坐像，神采奕奕，端庄而又慈祥。药王两侧，分立着八名雄姿英发的武将，给正殿增加了庄重威严的气氛。正殿建筑宏伟，雕镂精湛，琉璃瓦覆盖，辉映耀目。

      安国药王庙的来历，有一个神话传说。相传宋秦王得疾，久治不愈，邳彤显灵治愈，宋秦王问其姓名，告之"祁州南门外人也"，"遣使即其地，始知为神"，遂封王建庙祀之。北宋建中靖国元年(公元1101年)追封邳彤为侯，后改封公，南宋咸淳六年(公元1270年)又加封为"明灵昭惠显王"。随着帝王对邳彤的不断封赐，"药王"影响越来越大。药王庙的建立，反映了后人对施德于民的邳彤的一种怀念之情。自从为邳彤建庙设祀以来，一般民众有病求助于药王，善男信女，常来进香，业药者乘机售药，以至逐渐形成了每逢农历四月二十八的药材庙会，历经几百年而不衰，以至有"草到安国始成药，药到祁州始生香"的说法。